Esta sala contiene información de la cultura mixteca desde que los primeros habitantes de Oaxaca están documentados arqueológicamente en la Mixteca Alta (1500 a.c.), hasta el periodo postclásico (1521 d.c.). También contiene piezas arqueológicas y cerámica -más de 600- que el Patronato ha recuperado de la población que pertenecen a la Fase Ñudee y a la Fase Ñuiñe, así como de los periodos preclásico, clásico y postclásico de la cultura mixteca. Por medio de pictogramas se muestra al público de manera gráfica la escritura y la numeración de punto y barra que se utilizó en el área ñuiñe de la cultura mixteca.

La región de la Mixteca está dividida en tres grandes secciones, separadas entre sí por la geografía, altura y ecología. La Mixteca Alta, la Mixteca Baja, donde se encuentra Huajuapan, y la Mixteca de la Costa. Un mural, en la entrada de la sala, muestra la biodiversidad existente en la Mixteca, así como un mapa donde se señala la extensión de la Mixteca y sus divisiones geográficas.

La Sala de Arqueología del Museo Regional de Huajuapan se centra en la arqueología de la Mixteca Baja. Las piezas que forman la colección proceden, en su mayoría, de las excavaciones realizadas en el sitio arqueológico de Cerro de las Minas y también de Santa Teresa, Acatlima, San Pedro y San Pablo Tequixtepec, Tonalá, Coixtlahuaca, Tejupan y otros pueblos. Algunos objetos pertenecen a la cultura ñuiñe de la Mixteca Baja, que se desarrolló entre los años 400 a 800 después de Cristo. Destacan por su tamaño, calidad escultórica y estética, las lápidas encontradas en la tumba 5 de Cerro de las Minas, así como los bloques y basaltos de piedra grabados con fechas que aparentemente representan los nombres de algunos dignatarios y gobernantes. También característico de la cultura ñuiñe son las urnas de barro anaranjado, que muestran a un personaje anciano, posiblemente el Dios Viejo del Fuego.

Una vitrina, en la entrada del museo, exhibe regularmente la pieza del mes, un objeto arqueológico con su cédula explicativa correspondiente.

Elaboración del texto y las ilustraciones:
arqueólogo Ángel Iván Rivera Guzmán,
Instituto Nacional de Antropología e Historia. 2007